posiblemente se caliente porque la bateria que le conectastes esta algo descargada y el cargador de tu ups la esta cargando pero como es de mucho mayor capacidad se sobrecalienta el cargador, porque ahora le toma mas tiempo.

esta muy baja la bateria, bueno el cargador es normal que caliente ya que la bateria que le pusiste exprime por completo la corriente del cargador, y como es de mucha capasidad, el cargador se ve forzado a trabajar durante mas tiempo para poder cargar esa bateria, recuerda que el cargador esta diseñado para cargar una pila mucho menor

en teoria deveria funcionar sin problema, pero pociblemete el transistor que carga la bateria esta en un disipador de calor muy pequeño.

Una pocible solucion es identificar dicho transistor y montarlo en algun disipador mucho mas grande, o incluir un ventilador que refrigere.

Sobre las resistencias que mencionas no tengo idea pero VR3 OCP suena a proteccion de sobrecorriente no creo que se devan mover esas resistencias.